Az istenek megelégelték Atlantisz virágzását és őket megszégyenítö tündöklését, ezért úgy döntöttek, hogy a tenger mélyére süllyesztik. De Zeusz fivére Poszeidon, a tengerek istene szembeszállt a többi istennel hogy megvédje a várost, de sajnos legyőzték őt és Zeusz elvette hatalma forrását, amit Atlantiszon rejtettel el, hogy a várossal együtt az is örökre a tenger mélyére süllyedjen. A játékosok feladata hogy bejussanak a városba és visszaszerezzék a tenger istenének hatalmát amivel megmenthetik a várost és ők is kiszabadulhatnak. A küldetés végrehajtására egy órájuk maradt különben a város velük együtt örökre a tenger mélyére süllyed.